96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1628 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  69.23 
 
 
316 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  36.89 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  33.03 
 
 
351 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  31.19 
 
 
378 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  30.58 
 
 
370 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  31.07 
 
 
334 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  30.54 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.55 
 
 
350 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  25.7 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  25.47 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  28.28 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  27.01 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  24.92 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  27.54 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
586 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  28.16 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  25.41 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  23.51 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  27.27 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  25.81 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.8 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  24.18 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  24.26 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  20.85 
 
 
775 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  25.77 
 
 
574 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  23.75 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  22.92 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  25.35 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  22.89 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  20.56 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  25.83 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  28.46 
 
 
281 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  19.66 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  27.86 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  25.1 
 
 
344 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  23.02 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  22.78 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  27.13 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  23.49 
 
 
342 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  30.37 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  25.81 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  25.71 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  24.91 
 
 
322 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  25.76 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  25.7 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  22.53 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  22.53 
 
 
359 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  21.48 
 
 
320 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  20.82 
 
 
606 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  25.19 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  24.05 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  24.38 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  25.32 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  26.36 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  24.85 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  28.03 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  25.28 
 
 
322 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  29.46 
 
 
298 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  20.09 
 
 
346 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  25.51 
 
 
347 aa  50.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  23 
 
 
793 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  23.73 
 
 
326 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  31.68 
 
 
289 aa  50.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  26.05 
 
 
317 aa  49.3  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  25.66 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  26.62 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  22.55 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  23.44 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  30.59 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  19.93 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  20.42 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  27.92 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  28.43 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  24.43 
 
 
333 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  27.97 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  22.88 
 
 
346 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  23.79 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  26.19 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  21.72 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  23.79 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  22.59 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  22.27 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  19.67 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  27.89 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  27.08 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.92 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  29.7 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  27.91 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  22.39 
 
 
378 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  27.17 
 
 
392 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  23.86 
 
 
289 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1193  hypothetical protein  27.33 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.41231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  22.18 
 
 
803 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  21.24 
 
 
801 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>