40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0577 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  714    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  26.9 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  24.44 
 
 		 326 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  31.48 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  25.8 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  27.17 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  26.56 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  29.84 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  29.93 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  30 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  24.22 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  32.52 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  23.53 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  24.35 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  25.29 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  22.7 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  21.75 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  29.82 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  25.88 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  25.95 
 
 		 350 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  21.28 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  28.97 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  24.71 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  29.03 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3319  hypothetical protein  25.22 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  22.15 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  24.69 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  29.96 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  21.23 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  21.36 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  29.06 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  20.76 
 
 		 316 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  34.4 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2411  hypothetical protein  24.62 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.06 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  26.32 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  27.35 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  23.81 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>