66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3582 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  92.97 
 
 		 370 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  750    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  72 
 
 		 351 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  48.94 
 
 		 386 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  40.62 
 
 		 334 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  33.12 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  36.68 
 
 		 320 aa  176  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  30.03 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  26.28 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  26.57 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  27.24 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 586 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  23.74 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  24.04 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.15 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  27.49 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.05 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  27.85 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  24.3 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  22.66 
 
 		 574 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  22.01 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  23.99 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  26.91 
 
 		 323 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  29.25 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.91 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  22.74 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  22.34 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  25.25 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  28 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  26.74 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.7 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  25.76 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  22.22 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  28.44 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  21.77 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  22.22 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 613 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  34.29 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  35.24 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  26.69 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  26.33 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  27.6 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  27.05 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  30.19 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  22.08 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.93 
 
 		 775 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  26.09 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  24.69 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  32.56 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  29.17 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 606 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  25.98 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  27.42 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  26.35 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  25.08 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  26.14 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  32.48 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  25.74 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  23.11 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  27.61 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  32.41 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  29.09 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  27.89 
 
 		 793 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  25.68 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  26.26 
 
 		 335 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>