33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01440 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  40.82 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  34.75 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  35.67 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  32.9 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  32.57 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  30.63 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  28.9 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  28.92 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  22.96 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  35.05 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  36.36 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  35.19 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  21.48 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  25.77 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 586 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  24.74 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  22.66 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  40.79 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  31.13 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  24.3 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.46 
 
 		 360 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  24.31 
 
 		 370 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  30.7 
 
 		 378 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  22.92 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  23.5 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  24.65 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  22.7 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  24.6 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  24.71 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  32.99 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.27 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  23.83 
 
 		 334 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>