91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0089 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  700    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  92.38 
 
 		 328 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  68.11 
 
 		 346 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  60.49 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  34.81 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  31.13 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  31.46 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  29.09 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  29.39 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  29.25 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  28.83 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  32.08 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  29.29 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  29.45 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  29.63 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  29.59 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  27.82 
 
 		 339 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  26.57 
 
 		 378 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  29.29 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  29.57 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.35 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 586 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  27.76 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  25.68 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  26.94 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  27.68 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  27.22 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  26.17 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.55 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  27.84 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  26.22 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  25.39 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.74 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  22.76 
 
 		 330 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  26.44 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.06 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 606 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  23.27 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  28.1 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  23.4 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.03 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  26.54 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  25.41 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  23.68 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  25.41 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  24.76 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  24.9 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  21.32 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  23.3 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  24.81 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  23.74 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  28.68 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  37.14 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  31.75 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  22.77 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  22.97 
 
 		 574 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.85 
 
 		 775 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  29.44 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  27.67 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  32.23 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  26.63 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  22.92 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  18.68 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 613 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  27.11 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  22.98 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  27.1 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  24.24 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  24.56 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.55 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  28.71 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  27.94 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  26.69 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  24.62 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  20.2 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1542  hypothetical protein  29.31 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  27.97 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  27.15 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  22.26 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  24.36 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1447  hypothetical protein  29.31 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2416  hypothetical protein  27.78 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0787706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  24.19 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  37.31 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  27.69 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  37.31 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  25.98 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  27.11 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>