67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1628 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  92.33 
 
 		 340 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  64.6 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  55.35 
 
 		 336 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  55.76 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  48.15 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  52.24 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  29 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  29.09 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  32.52 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  28.1 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  28.44 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  32.86 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  32.5 
 
 		 363 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  32.14 
 
 		 363 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  26.32 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  26.85 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  25.52 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  27.39 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  25.07 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  22.74 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  28.14 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  25.23 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  25.66 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  31.91 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  24.61 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  25.5 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  30.6 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.3 
 
 		 775 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  27.81 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  27.91 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  21.66 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 		 606 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  35.19 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  24.83 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  23.68 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  24.05 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  24.4 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  36.19 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  29.84 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  25.83 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  27.94 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  25.29 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  25.17 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  35.24 
 
 		 378 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  27.22 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  34.29 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.19 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  28.45 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  23.89 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  27.61 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  24.83 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  21.64 
 
 		 586 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  26.71 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  29.81 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4197  hypothetical protein  28.57 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  28.68 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  30.26 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  25.2 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  29.13 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  31.46 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  27.5 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  32.23 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  24.35 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  28.16 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>