31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1493 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  694    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  30.65 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  30.63 
 
 
342 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  28.53 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  30.82 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  30.22 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  28.01 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  27.67 
 
 
298 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  28.83 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  27.15 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  24.12 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  26.09 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  24.48 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  25.3 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
586 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.68 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  25.24 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.65 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  20.74 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  32.2 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  25 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  22.33 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  44.16 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  27.74 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  26.21 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  29.41 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  21.69 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  20.55 
 
 
316 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  28.33 
 
 
321 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  29.7 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  30.19 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>