40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2249 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  685    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  45.77 
 
 
342 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  45.91 
 
 
347 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  46.22 
 
 
348 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  34.03 
 
 
346 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  33.44 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  33.75 
 
 
352 aa  193  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  32.43 
 
 
338 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  32.25 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  31.55 
 
 
347 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  31.87 
 
 
366 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  30.92 
 
 
342 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  31.36 
 
 
352 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  30.56 
 
 
340 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  23.93 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  27.61 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  22.62 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  27.68 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  22.96 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  27.41 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  22.59 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  23.61 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  23.61 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  26.42 
 
 
358 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  20.85 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  25.99 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.15 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  24.9 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  24.64 
 
 
342 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  20.28 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  24.63 
 
 
323 aa  47  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  27.78 
 
 
347 aa  47  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  24.72 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  29.73 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  19.76 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  26.03 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  26.09 
 
 
319 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  27.03 
 
 
392 aa  42.7  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  27.03 
 
 
338 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  27.43 
 
 
281 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>