32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0136 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  707    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  34.03 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  32.52 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  29.45 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  28.49 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  30.28 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  28.09 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  28.83 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  26.49 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  26.49 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  26.67 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  24.92 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.08 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  26.21 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  28.1 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.01 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  34.23 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  25.17 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.97 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  23.86 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  34.58 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  34.58 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  33.03 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  24.44 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  23.05 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  24.24 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  29.77 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.28 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  24.83 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>