63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2495 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  587  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  23.93 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  28.17 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  25.96 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  25.96 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  28.68 
 
 
350 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  21.45 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  21.58 
 
 
586 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  30.51 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  23.21 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  27.94 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  21.07 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  32.99 
 
 
337 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  21.26 
 
 
359 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  22.4 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  20.7 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  23.78 
 
 
351 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0725  hypothetical protein  23.67 
 
 
242 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.38 
 
 
316 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  18.39 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  28.57 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  28.17 
 
 
346 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  19.86 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  21.52 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  20.14 
 
 
313 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  23.28 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  21.52 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  28.75 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  19.29 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  28.68 
 
 
340 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  24.32 
 
 
327 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.47 
 
 
347 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  27.07 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  20.7 
 
 
339 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  22.14 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24.9 
 
 
340 aa  45.8  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  31.62 
 
 
346 aa  45.8  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  27.21 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  26.83 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  21.03 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  21.74 
 
 
574 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  24.79 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  22.76 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  29.79 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  27.93 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  25.69 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  24.44 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  30.38 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  28.85 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  23.29 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  28.43 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  27.78 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  20.43 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  21.99 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  32.14 
 
 
363 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  32.14 
 
 
363 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0401  hypothetical protein  22.67 
 
 
325 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.275015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  27.16 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  19.54 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  22.86 
 
 
386 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  24.24 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2184  hypothetical protein  23.86 
 
 
324 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>