53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3833 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  100 
 
 		 342 aa  692    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  39.7 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  41.06 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  35.14 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  32.25 
 
 		 298 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  30.63 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  32.3 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  33.13 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  32.65 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  27.69 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.39 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  24.61 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  23.95 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  25.41 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  25.99 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  31.62 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  22.61 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  25.08 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  25.17 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  22.61 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  23.68 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  23.75 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  28.1 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  30.51 
 
 		 297 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  23.22 
 
 		 574 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  26.55 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  21.52 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  30.4 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  28.69 
 
 		 341 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  23.49 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  30.48 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  24.5 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  23.4 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  23.94 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  32.56 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  20.82 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  25.34 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  31.75 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  31.75 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  25.55 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  25.36 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  24.26 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  33.93 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  36.27 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  25.98 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.11 
 
 		 775 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  22.29 
 
 		 606 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  26.13 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  34.69 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  27.94 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.79 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>