51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0692 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  643    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  54.71 
 
 
326 aa  346  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  52.78 
 
 
325 aa  345  8e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  51.41 
 
 
319 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  46.2 
 
 
333 aa  290  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  36.08 
 
 
574 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
606 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  31.15 
 
 
391 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  29.04 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  29.06 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  45.05 
 
 
613 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
586 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  25.2 
 
 
360 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  24.33 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.69 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  25.83 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  25.19 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  24.64 
 
 
378 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  24.42 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  23.94 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  25.19 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  25.29 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25.66 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  22.3 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  27.16 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  25.2 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  22.37 
 
 
351 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  22.51 
 
 
378 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  23.93 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.68 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.58 
 
 
370 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  22.68 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  26.53 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  24.05 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  23.15 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  22.49 
 
 
386 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  21.79 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  20.95 
 
 
317 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  24.37 
 
 
341 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  21.23 
 
 
318 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  22.1 
 
 
336 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  23.55 
 
 
325 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  25.83 
 
 
344 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  23.31 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  23.75 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  24.71 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  23.05 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  29.25 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  21.68 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  26.77 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>