38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3446 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  33.75 
 
 
360 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  28.32 
 
 
342 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  28.44 
 
 
339 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  30.96 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  27.39 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  27.84 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  27.48 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  25.24 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  29.31 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  25.41 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.11 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  22.42 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  26.1 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.1 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  28.28 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  26.51 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  24.48 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  23.75 
 
 
344 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  30.7 
 
 
298 aa  49.7  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  24.5 
 
 
341 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  23.25 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
606 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  29.36 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  34 
 
 
351 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  26.84 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  31.39 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  25.19 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  25.6 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  25.73 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  27.61 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  25 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  25.6 
 
 
347 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  24.07 
 
 
319 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>