36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2691 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  27.56 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.66 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  26.03 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.13 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  30.56 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  23.63 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1447  hypothetical protein  25.97 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  20.06 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  22.59 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1542  hypothetical protein  26.3 
 
 
329 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.05 
 
 
775 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  22.6 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  23.37 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.68 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  22.46 
 
 
341 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  27.04 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  27.91 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  23.29 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2416  hypothetical protein  27.02 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0787706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  27.11 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  20.82 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  21.72 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  32.35 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  23.02 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  25.16 
 
 
336 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  23.89 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  23.6 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  20.7 
 
 
574 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4197  hypothetical protein  29.08 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  26.26 
 
 
378 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  26.79 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  25.26 
 
 
330 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  24.19 
 
 
363 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>