68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1389 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  58.33 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  66.03 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  55.35 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  56.27 
 
 		 340 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  48.62 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  51.23 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  30.15 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  28.53 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  29.25 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  28.52 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  29.76 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  30.28 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  29.66 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  31.21 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  28.97 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  28.97 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  30.34 
 
 		 378 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  29.35 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  25.76 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  25.88 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  26.76 
 
 		 574 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  28.32 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  23.73 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.68 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.34 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  25.33 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  23.49 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  23.15 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  30.99 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  23.51 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  27.05 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 		 606 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  27.24 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  23.31 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.81 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 		 613 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  23.57 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  22.64 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  31.36 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  24.05 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  31.62 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  27.61 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  24.51 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.08 
 
 		 775 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  23.81 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  25.51 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  25.4 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  24.84 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  23.33 
 
 		 326 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  26.81 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  22.12 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  25.87 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  25.09 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  21.93 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  27.07 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  24.85 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  27.34 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  26.69 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  25.5 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  42.53 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  26.84 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  19.58 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  22.55 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  27.97 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  25.15 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>