59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0723 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  643    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  53.52 
 
 		 325 aa  349  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  53.52 
 
 		 333 aa  348  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  54.71 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  50.31 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  34.6 
 
 		 574 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 		 606 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  35.64 
 
 		 391 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 613 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  26.44 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 586 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.18 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  26.82 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  28.64 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.08 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  26.54 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  27.09 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  25.45 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  27.55 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  24.72 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  28 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  23.75 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  26.46 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  24.48 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  20.31 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  25.29 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  24.17 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  25.4 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  26.13 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  28.8 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  27.04 
 
 		 335 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  30.16 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  25.64 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  24.83 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  25.85 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  22.01 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  25.25 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  26.59 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  21.69 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  23.25 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  19.3 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  24.71 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  22.13 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  24.71 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  27.45 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  21.69 
 
 		 317 aa  45.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  22.83 
 
 		 298 aa  46.2  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  23.26 
 
 		 334 aa  45.8  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  22.97 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  23.1 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  25.35 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  25.89 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  38.03 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  30.77 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  19.05 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  20.89 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  30.85 
 
 		 801 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  23.38 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  23.67 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>