53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3323 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  100 
 
 		 801 aa  1557    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  69.48 
 
 		 793 aa  974    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  53.87 
 
 		 843 aa  712    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  41.15 
 
 		 854 aa  462  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  36.81 
 
 		 773 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  38.54 
 
 		 792 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  38.92 
 
 		 809 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  32.1 
 
 		 862 aa  317  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  33.89 
 
 		 872 aa  317  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  32.36 
 
 		 859 aa  299  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  39.12 
 
 		 916 aa  285  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  33.17 
 
 		 873 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  35.38 
 
 		 783 aa  260  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  28.55 
 
 		 853 aa  213  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  26.65 
 
 		 811 aa  207  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  26.83 
 
 		 795 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  27.85 
 
 		 803 aa  191  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  30.47 
 
 		 787 aa  191  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  30.47 
 
 		 787 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  30.47 
 
 		 787 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  28.02 
 
 		 795 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  30.18 
 
 		 313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  32.52 
 
 		 442 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  31.01 
 
 		 329 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  28.27 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  30.99 
 
 		 293 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  30 
 
 		 318 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  30.38 
 
 		 1195 aa  58.9  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  35.9 
 
 		 247 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  35.9 
 
 		 346 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  35.35 
 
 		 392 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  37.37 
 
 		 355 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  33.9 
 
 		 392 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  21.1 
 
 		 321 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  53.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  27.03 
 
 		 378 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  27.03 
 
 		 378 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  27.03 
 
 		 378 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  25.91 
 
 		 345 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  26.11 
 
 		 350 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  32.26 
 
 		 862 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2265  hypothetical protein  28.29 
 
 		 333 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  20.78 
 
 		 316 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  25.91 
 
 		 345 aa  47.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  32.46 
 
 		 367 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  26.78 
 
 		 392 aa  47  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  44.23 
 
 		 339 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  23.39 
 
 		 321 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  37.88 
 
 		 320 aa  45.8  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  38.95 
 
 		 342 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  38.67 
 
 		 362 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  32.22 
 
 		 861 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  22.97 
 
 		 351 aa  44.3  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>