40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4504 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  68.65 
 
 		 319 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  56.43 
 
 		 330 aa  345  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  57.37 
 
 		 350 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  55.94 
 
 		 320 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  54.84 
 
 		 313 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  31.44 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  27.92 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  27.27 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  27.27 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  31.97 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  27.63 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  26.97 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  26.35 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  26.18 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  27.95 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  27.34 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  22.63 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  25.23 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  23.46 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  24.52 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  22.22 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  29.6 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  31.68 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  24.44 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  30.72 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  24.62 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.37 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  43.08 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  26.1 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  27 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  24.03 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  26.48 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  31.53 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  19.54 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  30.28 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  29.7 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  34.78 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  44.9 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  29.58 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>