17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1029 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  767    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  29.61 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  24.57 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  24.57 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  28.1 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  30.91 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25.27 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  23.53 
 
 		 326 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  26.67 
 
 		 298 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  28.7 
 
 		 320 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  31.58 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2411  hypothetical protein  22.22 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  30.95 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  32.84 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  26.32 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  30.34 
 
 		 303 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  29.7 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>