41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1174 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  50.67 
 
 
326 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  36.99 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  38.63 
 
 
278 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  30.86 
 
 
349 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  43.13 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  41.31 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  39.93 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  37.63 
 
 
353 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  27.95 
 
 
302 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  34.73 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  27.88 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  31.94 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  31.82 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  27.74 
 
 
350 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  27.92 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  27.64 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  30.22 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  21.45 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  28.83 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  29.94 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  29.94 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  32.32 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1682  hypothetical protein  46.05 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  37.27 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  25.84 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  25.85 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  25.31 
 
 
303 aa  59.3  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  25.15 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  35.04 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  34.91 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  23.79 
 
 
347 aa  53.5  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  24.04 
 
 
295 aa  52.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  25.4 
 
 
347 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  30.56 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  20.72 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.66 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  23.18 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  25.27 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  25.22 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3319  hypothetical protein  25.11 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>