23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0412 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  98.01 
 
 		 302 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  28.43 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  22.12 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  34.33 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  30.65 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  27.99 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  26.2 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  24.54 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  27.01 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  31.5 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.19 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  23.29 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  28.7 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  30.63 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  24.22 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  21.23 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  40.91 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  26.18 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  21.02 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  25.81 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>