37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1073 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  84.8 
 
 
350 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  57.14 
 
 
313 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  58.49 
 
 
320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  56.43 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  61.76 
 
 
319 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  32.34 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  28.79 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  25.63 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  29.43 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  29.69 
 
 
314 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  29.01 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  33.47 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  34.71 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  27.06 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  25.89 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  26.22 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  25.62 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  23.68 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  25.84 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  23.74 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  24.6 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  28.73 
 
 
343 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  28.8 
 
 
326 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  29.07 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  23.49 
 
 
289 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  41.03 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  19.86 
 
 
297 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  30.34 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  33.33 
 
 
353 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  28.05 
 
 
312 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  31.58 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.63 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  30.45 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  22.82 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>