36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1301 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  84.8 
 
 		 330 aa  549  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  56.45 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  59.87 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  57.37 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  61.44 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  30.23 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  28.35 
 
 		 319 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  27.15 
 
 		 302 aa  93.6  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  33.47 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  28.7 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  32.68 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  26.77 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  27.18 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  26.07 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  23.45 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  24.37 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  23.4 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  23.62 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  25.99 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  24.29 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  24.03 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  21.37 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  23.82 
 
 		 289 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  28.85 
 
 		 288 aa  52.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  31.71 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  27.31 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  53.06 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  22.96 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  30.91 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  25.22 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  25.57 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  28.96 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  28.69 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  38.71 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  29.15 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>