37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0745 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  28.71 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  30.61 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  31.08 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  32.86 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  31.4 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  29.45 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  23.1 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  27.18 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  27.18 
 
 		 359 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  30.92 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  26.55 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  29.08 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  35.11 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  28.66 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1527  hypothetical protein  34.43 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  26.4 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  28.25 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  27.02 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  23.96 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  26.8 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  26.59 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  36.59 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  28.21 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  28.47 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  34.91 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  24.53 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  22.57 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  30.77 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.17 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  36.56 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  25.35 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  36.23 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  25.64 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  33.63 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>