28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2748 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  86.32 
 
 
312 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  47.92 
 
 
343 aa  185  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  49.83 
 
 
353 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  42.25 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1682  hypothetical protein  48.03 
 
 
248 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  43.58 
 
 
326 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  36.73 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  34.92 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  31.21 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  29.08 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  25.8 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  35.09 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  26.09 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  26.02 
 
 
316 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  20.57 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  26.07 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  24.05 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  27.88 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  25.62 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  20.14 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  27.17 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  25.73 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  25.73 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  21.95 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  24.78 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  26.09 
 
 
325 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>