32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0536 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  31.18 
 
 
314 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  34.25 
 
 
326 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  31.46 
 
 
278 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  41.8 
 
 
321 aa  86.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  30.72 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  27.19 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  25.07 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  25.07 
 
 
359 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  32.84 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  42.71 
 
 
353 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  28.23 
 
 
343 aa  56.2  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  42.68 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  24.79 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  24.66 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  30.71 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  35.92 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  34.94 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  33.03 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  43.08 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1682  hypothetical protein  48.98 
 
 
248 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  24.23 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  38.27 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  37.17 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  33 
 
 
303 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  22.55 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  31.18 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  31.48 
 
 
305 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  28.43 
 
 
319 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  29.36 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  40 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>