36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1606 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  620  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  68.65 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  61.76 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  61.44 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  59.55 
 
 		 320 aa  351  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  56.13 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  32.89 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  29.18 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  31.99 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  25.96 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  26.98 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  26.75 
 
 		 359 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  30.2 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  28.12 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  32.13 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  25.85 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  24.3 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  22.87 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  26.17 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  23.55 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  38.16 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  23.57 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.45 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  29.25 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  30.6 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  28.03 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  23.57 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  33.62 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  40 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  24.3 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  25.96 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  24.6 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0725  hypothetical protein  34.21 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  24.43 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  16.67 
 
 		 297 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>