26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0404 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  98.01 
 
 		 309 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  26.98 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  28 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  33.08 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  21.61 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  27.21 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  26.83 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  30.77 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  28.15 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  28.66 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  24.91 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  43.14 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  23.88 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  32.23 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  22.49 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  31 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  24.79 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  25.18 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  21.99 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  40.91 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  25.65 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  31 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  20.71 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>