43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1672 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  607  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  73.27 
 
 
319 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  64.09 
 
 
298 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  63.48 
 
 
297 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  60.69 
 
 
305 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  57.04 
 
 
295 aa  348  7e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  58.91 
 
 
288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  32.5 
 
 
289 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  24.15 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  24.7 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  23.68 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  23.91 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  23.36 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25.6 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  25.09 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  24.68 
 
 
359 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  24.68 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  26.24 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  26.96 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  24.43 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  27.13 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  33 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  23.49 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  24.08 
 
 
314 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  22.6 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  29.59 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.28 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  29.03 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  25.41 
 
 
319 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  25.93 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  25.62 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  25 
 
 
574 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  30.77 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  34.15 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  21.69 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  23.47 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  23.47 
 
 
338 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  21.74 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  26.4 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  22.37 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  25.87 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  23.55 
 
 
351 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>