60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2008 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  100 
 
 		 348 aa  689    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  50.88 
 
 		 342 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  46.61 
 
 		 344 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  43.07 
 
 		 347 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  35.73 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  33.9 
 
 		 352 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  34.26 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  32.55 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  31.33 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  30.41 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  34.82 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.84 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  31.23 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  29.34 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.98 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  27.08 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  28.7 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.81 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  24.32 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  24.51 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  22.35 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  24.11 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  23.27 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  26.17 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  27.57 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  24.92 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  27.3 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  21.86 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  24.76 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  24.1 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  22.77 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  22.71 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  22.71 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  30 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  21.69 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  26 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  25.77 
 
 		 385 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  31.53 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  23.99 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  23.6 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  21.04 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  23.67 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0384  hypothetical protein  31.58 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  21.53 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  25.63 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  20.36 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  23.67 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.35 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  22.68 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  29.13 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  21.43 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  26.57 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  25.54 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  19.29 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  24.63 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  25.32 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  28.04 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  23.9 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  20.93 
 
 		 392 aa  42.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>