39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4166 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  51.76 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  43.96 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  38.87 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  38.37 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  34.42 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  29.63 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  29.91 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  29.63 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  29.7 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  36.26 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  44.21 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  27.45 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  26.42 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  30.45 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  28.2 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  33.07 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  32.78 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  26.56 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  30.8 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  26.98 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  28.78 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  26.05 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  24.13 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  29.17 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  32.95 
 
 		 347 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  19.03 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1682  hypothetical protein  43.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  35.4 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  24.32 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  35.9 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  35.4 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  40.57 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  24.37 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  28.3 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.09 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  23.93 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>