26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0463 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  63.19 
 
 
298 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  63.07 
 
 
297 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  63.19 
 
 
305 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  60 
 
 
295 aa  338  5e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  58.91 
 
 
303 aa  333  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  55.07 
 
 
319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  34.57 
 
 
289 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  26.78 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  23.13 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  23.13 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  22.11 
 
 
313 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  24.82 
 
 
370 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  23.68 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  24.82 
 
 
378 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  24.62 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25.54 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  22.03 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  24.33 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  23.77 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  26.01 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  30.34 
 
 
380 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  21.69 
 
 
325 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  23.34 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  27.92 
 
 
322 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>