47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2070 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  677    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  56.08 
 
 
346 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  52.96 
 
 
352 aa  346  4e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  43.62 
 
 
347 aa  300  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  43.58 
 
 
337 aa  299  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  45.35 
 
 
366 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  44.71 
 
 
347 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  33.53 
 
 
347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  35.51 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  31.33 
 
 
348 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  31.8 
 
 
344 aa  175  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  34.3 
 
 
357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  25.23 
 
 
340 aa  138  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.01 
 
 
352 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  24.32 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  92.8  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  21.41 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.55 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  24.35 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  24.45 
 
 
330 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  22.93 
 
 
342 aa  62.8  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  24.45 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  25.2 
 
 
374 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  25.38 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  23.05 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  21.64 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  24.25 
 
 
335 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  21.18 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.73 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23.67 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  35 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  21.99 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  23.48 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  24.56 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  24.41 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  22.26 
 
 
340 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  23.08 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  24.22 
 
 
338 aa  46.2  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  23.69 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  23.15 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  21.54 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  25.28 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  23.47 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  22.98 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  25.25 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  25.6 
 
 
298 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>