47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1403 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  627  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  97.48 
 
 
318 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  32.89 
 
 
327 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  29.69 
 
 
326 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  29.9 
 
 
325 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  30.41 
 
 
309 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  28.99 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  27.71 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  30.56 
 
 
339 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  26.13 
 
 
344 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  28.91 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  24.72 
 
 
322 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  25.5 
 
 
323 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.57 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  26.76 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  25.9 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 
586 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  23.24 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  24.3 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  22.18 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  22.81 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  25.96 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.35 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  24.51 
 
 
334 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  24.64 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  21.93 
 
 
351 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  23.2 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  21.34 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.45 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  25.35 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  20.7 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  28.44 
 
 
247 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  24.3 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  22.36 
 
 
340 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  20.69 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  23.57 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  20 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  20.98 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  19.05 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  21.23 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  21.28 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  20.6 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  24.41 
 
 
811 aa  43.5  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  22.7 
 
 
341 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  20.56 
 
 
340 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  20.16 
 
 
340 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>