42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0634 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  73.01 
 
 		 305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  66.78 
 
 		 297 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  64.09 
 
 		 303 aa  378  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  65.62 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  65 
 
 		 288 aa  353  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  61.74 
 
 		 319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  36.19 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  25.55 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  26.22 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  26.03 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  25.87 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  25.52 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  25.25 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  24.73 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.93 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  23.86 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  26.76 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  33.03 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  30.56 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  20.5 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  21.28 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  27.34 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.78 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  28.1 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  30.26 
 
 		 340 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  30.28 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  24.25 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  25.66 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  26.67 
 
 		 380 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  30.26 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  27.93 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  24.03 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  33.77 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  26.81 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  25.6 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  22.64 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  34.04 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  24.24 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  21.02 
 
 		 574 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>