39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2204 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  66.78 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  69.93 
 
 		 305 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  64.14 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  63.48 
 
 		 303 aa  374  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  63.07 
 
 		 288 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  55.89 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  33.45 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  26.99 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  24.03 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  25.48 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  23.53 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  23.53 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  25.63 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  22.46 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  25.61 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  25.4 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  22.65 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  31.5 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  25.44 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  32.23 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  24.16 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  27.18 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  24.32 
 
 		 320 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  23.97 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.36 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  22.63 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  20.35 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  24.32 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  29.36 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3319  hypothetical protein  22.78 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  24.27 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  25.69 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  32.84 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  25.48 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  22.57 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  22.22 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  25.21 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  24.32 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>