80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1494 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  660    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  53.52 
 
 
326 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  43.07 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  42.12 
 
 
319 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  46.2 
 
 
326 aa  269  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  34.88 
 
 
574 aa  169  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
606 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  32.78 
 
 
391 aa  142  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 
613 aa  89.4  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  28.46 
 
 
316 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.59 
 
 
586 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  21.74 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.42 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  24.77 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  24.63 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  23.33 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  25 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  23.51 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.43 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  22.01 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  25.6 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  25.09 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  25.95 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  21.64 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  23.81 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  23.99 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  22.74 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  23.51 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  24.82 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  24.26 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  23.68 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  21.65 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  23.88 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  20.48 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  23.74 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  23.01 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  25.36 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  22.57 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  21.91 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  22.44 
 
 
346 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  28.07 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  22.99 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.95 
 
 
347 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2265  hypothetical protein  31.11 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  22.89 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  21.72 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  23.58 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  23.37 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  22.26 
 
 
775 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.07 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  22.3 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  22.98 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  23.14 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  22.75 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  19.93 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.24 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  21.21 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  29.36 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0957  conserved hypothetical conserved membrane protein  22.27 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  21.15 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  27.8 
 
 
292 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  20 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  23.04 
 
 
323 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  24.11 
 
 
333 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  20.92 
 
 
328 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  20.66 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  20 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  25.81 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  24.91 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  22.18 
 
 
281 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  24.22 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  23.97 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  25 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  23.53 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  21.65 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  20.85 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  23.16 
 
 
322 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  25.84 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  26.72 
 
 
247 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>