51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4079 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  695    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  34.94 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  27.6 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  26.85 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  22.7 
 
 		 360 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  26.91 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  26.99 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  26.73 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  25.73 
 
 		 328 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.75 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  24.92 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  26.28 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  28.21 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  29.08 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  25.44 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  26.55 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  26.39 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  22.33 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  29.25 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  27.6 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25 
 
 		 775 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  21.71 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  28.08 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  26.91 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  25.27 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.74 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  23.94 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  24.11 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  27.44 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  28.06 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  21.83 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  25.8 
 
 		 360 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  26.14 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.26 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  26.71 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  25.55 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  27.61 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  24.09 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  25.25 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  25.5 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 		 586 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  21.55 
 
 		 574 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  22.15 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  25.17 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  21.86 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  24.3 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  24.85 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1447  hypothetical protein  32.04 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  39.47 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  21.83 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>