31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1703 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  33.64 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  30.19 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  31.01 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  26.81 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  29.49 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  26.41 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  30.07 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  31.01 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  25.33 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  27.82 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  31.09 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  28.68 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  26.12 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  29.96 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  28.33 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.92 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  28.34 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  24.3 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  27.2 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  36.99 
 
 		 811 aa  46.6  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  34.18 
 
 		 859 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  36.36 
 
 		 783 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  25.35 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  37.88 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  34.18 
 
 		 793 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2265  hypothetical protein  35.29 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  29.67 
 
 		 851 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  28.28 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  23.39 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  35.78 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>