56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1200 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  36.19 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  37.66 
 
 
322 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  33.94 
 
 
323 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  34.34 
 
 
320 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  30.99 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  30.71 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  32.08 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  32.2 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  28 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  32.61 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  25.19 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  31.99 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  31.88 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  30.38 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  25.3 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  43.01 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  26.02 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  22.47 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  43.01 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  27.3 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.08 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  23.39 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  27.43 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25.61 
 
 
320 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  25.36 
 
 
380 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0657  hypothetical protein  27.69 
 
 
316 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  25.65 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  32.41 
 
 
854 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  27.13 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.02 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  26.2 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  25.11 
 
 
351 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.35 
 
 
859 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.35 
 
 
859 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.65 
 
 
783 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  36.54 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  29.35 
 
 
858 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  28.26 
 
 
861 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  27.78 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  23.25 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  29.47 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  25.38 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  28.26 
 
 
861 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  28.26 
 
 
861 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  28.26 
 
 
861 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  28.26 
 
 
861 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  28.26 
 
 
861 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28.26 
 
 
861 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28.26 
 
 
861 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  26.67 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  23.91 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  28.42 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  25.48 
 
 
334 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>