30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1552 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  557  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  30.39 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3094  conserved hypothetical conserved membrane protein  24.14 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.592106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0657  hypothetical protein  23.86 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0957  conserved hypothetical conserved membrane protein  22.22 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1379  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  25.09 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.41 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.42 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1773  hypothetical protein  22.81 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.600035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2187  hypothetical protein  24.29 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  25.55 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1108  hypothetical protein  21.43 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62512  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1413  hypothetical protein  24.8 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  26.49 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  29.08 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  27.05 
 
 		 346 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  26.27 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  28.87 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  27.8 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 586 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  31.62 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  25.65 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  27.82 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  26.4 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  32.18 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  26.67 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  26.61 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>