41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1965 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  607  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  37.07 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  36.3 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  34.66 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  36.31 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  36.42 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  38.33 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  28.03 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  27.71 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  34.32 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  29.14 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  31.91 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  31.21 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  31.21 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  35.25 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  30.07 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  27.54 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  25.29 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  29.55 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  28.63 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  29.44 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  20.36 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  37.74 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  21.29 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  27.23 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  38.78 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  31.94 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  22.18 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  24.07 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  30.6 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  21.8 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  32.91 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  30.67 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  27.05 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  29.38 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  30.47 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  27.78 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  29.1 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  27.54 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  20.42 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>