41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4446 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  91.21 
 
 		 330 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  90.91 
 
 		 330 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  82.12 
 
 		 330 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  61.74 
 
 		 332 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  58.02 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  57.1 
 
 		 333 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  58.22 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  49.68 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  36 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  26.63 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  22.98 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  23.08 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  23.49 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  27.04 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  26.45 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  23.51 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  21.6 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  22.05 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  20.24 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  20.76 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.03 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  28.88 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  21.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  21.54 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  23.59 
 
 		 345 aa  49.3  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0043  hypothetical protein  23.98 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  27.95 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  26.75 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  34.65 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  27.64 
 
 		 342 aa  45.8  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  28.28 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  30.61 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  27.87 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  29.1 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  24.53 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  24.19 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  26.21 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  26.69 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  29.2 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>