29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4029 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  72.5 
 
 
319 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  41.13 
 
 
322 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  33.1 
 
 
315 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  37.3 
 
 
323 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  37.2 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  34.23 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  31.21 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  30.94 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  28.27 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  30.42 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  29.28 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  28.12 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  27.84 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  28.68 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  21.01 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  30.85 
 
 
378 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  20.62 
 
 
318 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  28.26 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  30.9 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  30.55 
 
 
351 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2265  hypothetical protein  22.73 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  26.47 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  26.47 
 
 
330 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  44.93 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  34.39 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  23.79 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  36.99 
 
 
859 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  20.94 
 
 
586 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>