41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4203 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  726    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  31.33 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  28.12 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  27.27 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  34.9 
 
 
329 aa  62.8  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  26.57 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2065  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
750 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1563  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
743 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  38.37 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1430  hypothetical protein  30.2 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12769  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  28.96 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  30.33 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  30.58 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  29.79 
 
 
859 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  27.49 
 
 
346 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  30.58 
 
 
378 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  30.58 
 
 
378 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  27.01 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  42.35 
 
 
783 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  60 
 
 
811 aa  51.6  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  35.37 
 
 
320 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  26.57 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  27.84 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  44 
 
 
853 aa  49.7  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  25.97 
 
 
247 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  39.24 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32280  hypothetical protein  27.34 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  40 
 
 
793 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  28.25 
 
 
861 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  25 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  35.21 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  39.29 
 
 
1195 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  37.97 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  30.67 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  36.71 
 
 
345 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  30.23 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  29.76 
 
 
320 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  33.96 
 
 
339 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  28.51 
 
 
773 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  30.59 
 
 
318 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>