61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3529 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  627  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  32.89 
 
 
318 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  32.57 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  39.58 
 
 
309 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  36.42 
 
 
320 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  35.76 
 
 
326 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  36.86 
 
 
325 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  34.65 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  33.56 
 
 
315 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  37.97 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  35.2 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  37.46 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  32 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  30.71 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  30.53 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  29.28 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.54 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  25.74 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  27.56 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  22.67 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  26.8 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  27.72 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  20.21 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  25.24 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  25.65 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.69 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  25.32 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  25.31 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.71 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  35.64 
 
 
853 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.91 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  21.57 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.67 
 
 
338 aa  53.1  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  27.66 
 
 
330 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  27.66 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  22.08 
 
 
586 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  29.91 
 
 
330 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  24.24 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  23.19 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  36.15 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  27.15 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  24.32 
 
 
297 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  32.56 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  23.33 
 
 
339 aa  47  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  24.32 
 
 
346 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  24.18 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  38.66 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  25.5 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2237  hypothetical protein  26.6 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  17.92 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  24.8 
 
 
811 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  32.12 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  20.57 
 
 
574 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.94 
 
 
783 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  26.36 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  24.21 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  24.8 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  34.25 
 
 
859 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  28.17 
 
 
324 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  31.13 
 
 
377 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  34.71 
 
 
795 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>