50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3265 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  50.34 
 
 
862 aa  730    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  57.56 
 
 
872 aa  820    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  100 
 
 
859 aa  1653    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  50.98 
 
 
873 aa  635  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  52.55 
 
 
916 aa  485  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  35.14 
 
 
793 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  31.17 
 
 
853 aa  314  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  33.96 
 
 
843 aa  312  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  32.36 
 
 
801 aa  308  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  31.46 
 
 
854 aa  303  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  26.48 
 
 
811 aa  282  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  33.44 
 
 
792 aa  253  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  37.23 
 
 
809 aa  248  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  29.93 
 
 
773 aa  228  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  28.9 
 
 
803 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  34.53 
 
 
783 aa  211  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  28.4 
 
 
795 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  28.12 
 
 
795 aa  180  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  28.64 
 
 
787 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  28.52 
 
 
787 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  28.52 
 
 
787 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  30.77 
 
 
313 aa  122  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  37.27 
 
 
293 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  30.3 
 
 
442 aa  89.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  27.34 
 
 
447 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  28.29 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  31.02 
 
 
323 aa  59.3  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  33.85 
 
 
392 aa  58.9  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  31.86 
 
 
345 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  30.97 
 
 
345 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  25.15 
 
 
348 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  42.68 
 
 
396 aa  53.9  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  25.9 
 
 
346 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.78 
 
 
315 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  30.84 
 
 
367 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  55.56 
 
 
374 aa  51.2  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  38.67 
 
 
344 aa  48.1  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  39.24 
 
 
322 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  26.01 
 
 
281 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.52 
 
 
352 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  30.91 
 
 
378 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  34.18 
 
 
335 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  30.91 
 
 
378 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  30.91 
 
 
378 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  33.73 
 
 
392 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  29.79 
 
 
351 aa  46.6  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  38.18 
 
 
329 aa  45.8  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  34.15 
 
 
339 aa  45.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  25.94 
 
 
377 aa  44.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  40 
 
 
1195 aa  44.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>