52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1576 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1556    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  48.14 
 
 		 792 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  39.23 
 
 		 801 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  40.08 
 
 		 793 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  40.77 
 
 		 843 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  37.46 
 
 		 854 aa  321  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  33.85 
 
 		 773 aa  286  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  37.48 
 
 		 859 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  34.59 
 
 		 862 aa  273  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  31.64 
 
 		 872 aa  258  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  39.08 
 
 		 916 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  36.99 
 
 		 873 aa  244  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  35.6 
 
 		 783 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  34.21 
 
 		 803 aa  194  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  32.46 
 
 		 795 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  32.9 
 
 		 795 aa  178  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  25.86 
 
 		 853 aa  152  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  34.21 
 
 		 787 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  34.21 
 
 		 787 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  34.21 
 
 		 787 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  26.98 
 
 		 811 aa  145  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  34.42 
 
 		 313 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  34.6 
 
 		 442 aa  108  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  31.94 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  31.42 
 
 		 329 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  32.26 
 
 		 293 aa  72.8  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  29.64 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  33.82 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  34.13 
 
 		 862 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  39.45 
 
 		 1195 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  36.72 
 
 		 396 aa  50.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  35.64 
 
 		 367 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  29.63 
 
 		 374 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  34.86 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  39.09 
 
 		 377 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  33.64 
 
 		 378 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  47.27 
 
 		 339 aa  48.9  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  33.64 
 
 		 378 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  33.64 
 
 		 378 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  39.02 
 
 		 861 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  39.53 
 
 		 872 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  32.58 
 
 		 342 aa  47.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  35.71 
 
 		 345 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.27 
 
 		 315 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  41.33 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  33.77 
 
 		 346 aa  46.2  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  29.43 
 
 		 348 aa  46.2  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  34.18 
 
 		 247 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  21.88 
 
 		 321 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  40 
 
 		 880 aa  45.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  33.93 
 
 		 345 aa  45.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  33.04 
 
 		 341 aa  44.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>