53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7814 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  100 
 
 
854 aa  1677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  43.36 
 
 
843 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  41.48 
 
 
801 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  42.2 
 
 
793 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  38.84 
 
 
773 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  31.69 
 
 
859 aa  328  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  40.46 
 
 
809 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  34.33 
 
 
792 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  30.03 
 
 
862 aa  293  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  29.67 
 
 
872 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  35.61 
 
 
916 aa  263  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  30.14 
 
 
873 aa  251  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.61 
 
 
783 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  30.48 
 
 
803 aa  194  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  30.78 
 
 
795 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  29.81 
 
 
795 aa  177  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  31.83 
 
 
787 aa  165  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  31.65 
 
 
787 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  31.65 
 
 
787 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  24.7 
 
 
811 aa  151  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  24.58 
 
 
853 aa  147  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  31.91 
 
 
442 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  32.55 
 
 
329 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  31.99 
 
 
313 aa  86.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  28.19 
 
 
447 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  39.78 
 
 
293 aa  64.7  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  27.8 
 
 
351 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  39.36 
 
 
318 aa  52  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 
571 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  29.41 
 
 
599 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0657  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
566 aa  50.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  47.92 
 
 
344 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.17 
 
 
657 aa  50.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  31.08 
 
 
341 aa  48.9  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
657 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
657 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
657 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
569 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
657 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  30.21 
 
 
377 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
657 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
657 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2868  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  27.23 
 
 
520 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  28.32 
 
 
656 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  42.86 
 
 
329 aa  47  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  27.83 
 
 
346 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
657 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
657 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
657 aa  47  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  27.45 
 
 
790 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 
706 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  22.06 
 
 
875 aa  44.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  36.11 
 
 
1195 aa  44.3  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>