48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0828 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  661    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  43.8 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  25.15 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1430  hypothetical protein  26.3 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  29.03 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  24.41 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  34.38 
 
 		 1195 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  28.53 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  29.93 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  33.05 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  40.51 
 
 		 811 aa  53.5  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  38.95 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2237  hypothetical protein  30 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  32.84 
 
 		 853 aa  52.8  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  21.84 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  26.56 
 
 		 773 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4804  hypothetical protein  33.08 
 
 		 365 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0479679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  26.42 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  32.12 
 
 		 783 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  20.45 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1993  hypothetical protein  32.24 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795631  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  39.56 
 
 		 873 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  25.61 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  27.37 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  26.09 
 
 		 793 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  25.81 
 
 		 247 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  29.6 
 
 		 351 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  28 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  34.15 
 
 		 859 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  27.92 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  24.24 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  28.41 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1279  hypothetical protein  27.66 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.408469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  24.3 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0874  inner membrane protein YbhN  24.3 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0906  inner membrane protein YbhN  24.3 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.409444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  24.3 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  24.3 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  25.68 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  32.41 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  31.71 
 
 		 861 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  31.58 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  26.82 
 
 		 350 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  28.4 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  28.4 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  25.62 
 
 		 858 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>